Analisis Variasi Genetik Sekuen Gen Pengkode Protein Spike Virus MERS-CoV (PopSet : 1843801421) Menggunakan RFLP Secara In Silico

Abstract

Middle East Respiratory Syndrome (MERS) merupakan penyakit pernafasan akibat virus yang menyerang saluran pernafasan. MERS-CoV diduga awalnya berasal dari unta yang hidup di negara-negara Timur Tengah. Penyebab MERS adalah betacoronavirus dan mekanisme transmisi spesifik penyakit ini antara manusia dengan unta. MERS-CoV menginfeksi melalui perlekatan antara protein spike dengan reseptor dipeptidyl peptidase-4 (DPP4) pada sel inang. Protein Spike bertanggung jawab untuk masuknya virus melalui perlekatan dan fusi dengan membran sel inang. Penelitian ini berfokus pada gen pengkode protein spike virus MERS-CoV yang bertujuan untuk mengetahui polimorfisme yang terjadi pada gen pengkode protein Spike virus MERS- CoV menggunakan metode RFLP secara in silico. Hasil RFLP in silico dalam penelitian ini menunjukkan bahwa adanya variasi genetik di dalam situs pengenalan dari enzim AflII (Alel A1 dan Alel 2 dengan frekuensi alel masing-masing 0,625 dan 0,375) di dalam 8 sekuen RNA dari gen pengkode protein Spike untuk Virus Mers-CoV NCBI PopSet 1843801421.