Optimasi Primer BCRP Sampel Sel Kanker Payudara (T47D) Dengan Menggunakan Real Time PCR

Abstract

Primer BCRP (Breast Cancer Resistance Protein) adalah sepasang oligonukleotida pendek (untaian DNA atau RNA) yang dirancang secara spesifik untuk mengamplifikasi (menduplikasi) segmen DNA tertentu dari gen BCRP melalui proses yang disebut Polymerase Chain Reaction (PCR). Gen BCRP mengkodekan protein transpor membran yang berperan penting dalam resistensi berbagai jenis obat, termasuk obat kemoterapi, pada sel kanker. Metode yang digunakan yaitu: isolasi DNA, real time PCR, elektroforesis. Untuk mengetahui hasil optimasi primer BCRP pada sampel kanker payudara (T47D). Hasil penelitian ini menggunakan BLAST primer BCRP pada sekuens forward 5’AAAGGCA TAGATCCT AAAGA TTGTC3’ dan sekuens reverse 5’TCTTTC TCAGCTG TTTTCC GGA3’ produk Panjang 225 bp. Penyejajaran sekuens produk adalah Length 25, TM 57.61. Hasil dari gradient Real Time PCR BCRP dengan suhu annealing 51oc-60oc didapatkan suhu optimum yaitu 54,5oc. qPCR menyediakan data yang mudah diinterpretasikan dengan alur kerja standar, sementara ImageJ memerlukan analisis dan keahlian manual, sehingga lebih sulit untuk menginterpretasikan hasil secara akurat.